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¿Qué considera uniprot evidencia “inequívoca” del dominio subcelular de una proteína?

¿Qué considera uniprot evidencia “inequívoca” del dominio subcelular de una proteína?


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Uniprot tiene una anotación para la ubicación subcelular de los dominios de proteínas. Esta información de dominio topológico de las proteínas se encuentra bajo elTOPO_DOMbandera.

En la mayoría de los casos, la ubicación subcelular se asigna mediante un análisis de secuencia riguroso tanto para las ubicaciones subcelulares verificadas experimentalmente como para las predichas. A veces hay información más confiable disponible ...

... cuando la técnica experimental utilizada permite la asignación inequívoca del límite transmembrana a una posición particular (cristalografía de rayos X, etc.), el calificador 'Análisis de secuencia' no se agrega en la anotación del dominio topológico. En este caso, las posiciones de los dominios topológicos se pueden propagar 'por similitud'.

¿Qué evidencia está disponible que constituye "asignación inequívoca" de manera que lapor similitudcalificador se puede utilizar?


A raíz de su pregunta, hemos actualizado la documentación para dominios topológicos en UniProtKB: http://www.uniprot.org/help/topo_dom

Espero que lo encuentre más informativo ahora. No dude en ponerse en contacto con el servicio de asistencia técnica de UniProt si tiene alguna pregunta adicional (o, si prefiere discutir aquí, una breve nota al servicio de asistencia técnica nos ayudaría a detectar su publicación de manera más confiable, ya que no podemos monitorear de cerca todos los foros como usted). puede entender).


Ver el vídeo: Evidence: Cómo innovamos para mejorar la síntesis de evidencia? (Octubre 2022).